Муки-Какси – старинное село, через которое проходил знаменитый Сибирский тракт. До 1918 г. оно входило в состав Малмыжского уезда Вятской губернии.
Библиотека открылась в 1899 г. в здании земской школы. В дальнейшем библиотеку закрыли; её второе рождение состоялось в 1949 г., когда в деревянном здании сельского клуба была открыта изба-читальня. Первым заведующим стала Антонида Прокопьевна Щербакова.
В 1961 г. библиотеку приняла Любовь Ивановна Никулина и тогда же, в начале 60-х гг., библиотека переехала в новое здание.
С 1968 по 1975 гг. в библиотеке работала Таисия Петровна Пирогова, с 1975 г. – Галина Шакировна Закирова. В последующие годы происходила частая смена библиотекарей, а сама библиотека пережила несколько переездов. С 1982 по 1991 гг. Муки-Каксинская сельская библиотека располагалась в здании бывшей этапной тюрьмы, в которой когда-то содержались политические ссыльные, следовавшие в Сибирь.
В 2006 г. в связи с оптимизацией библиотеку перевели в здание общеобразовательной школы.
С 2004 г. библиотекой заведует Зоя Михайловна Захарченко.
С 2015 г. после ухода, на пенсию Зои Михайловны библиотеку принимает молодой специалист Туркина Анастасия Валерьевна, которая проработала всего около полугода.
В этом же году ее сменяет Сафина Эльвира Рафаиловна, которая проработала в библиотеке 6 лет.
В настоящее время библиотекой заведует Астраханцева Татьяна Валентиновна.
В настоящее время сельская библиотека является неотъемлемой и самой значимой частью социальной структуры сельского поселения, общественной жизни местных сообществ, способствует социальному и духовному возрождению села, сохранению историко-культурного наследия малой Родины.